Ustavni sud Bosne i Hercegovine je 31. marta 2006. godine utvrdio da grb i zastava Federacije BiH, kao i grb i himna Republike Srpske, nisu u skladu sa Ustavom BiH. Parlamentima entiteta je naloženo da u roku od šest mjeseci usklade sporne odredbe.
Odluka Suda je zvanično stupila na snagu 14. juna 2007. godine objavljivanjem u “Službenom glasniku BiH”.
Tadašnji predsjedavajući Predsjedništva Bosne i Hercegovine Sulejman Tihić, podnio je 12. aprila 2004. godine Ustavnom sudu Bosne i Hercegovine zahtjev za ocjenu ustavnosti grba, zastava i himne oba bosanskohercegovačka entiteta.
Sporni grb Federacije Bosne i Hercegovine sastavljen je od tri dijela: u gornjem lijevom dijelu, na jednoj četvrtini grba, nalazi se štit sa zlatnožutim ljiljanom na zelenoj podlozi. U gornjem desnom dijelu, na drugoj četvrtini grba, nalazi se povijesni hrvatski grb sastavljen od 25 kvadratnih polja crvene i bijele boje. U donjem dijelu grba, plave boje, nalazi se 10 šestokrakih bijelih zvijezda poredanih u krug, koje zauzimaju polovinu grba. Grb i plavo polje optočeni su trakom zlatnožute boje.
Zastava Federacije Bosne i Hercegovine je pravougaona trobojnica sa vertikalno postavljenim poljima s lijeva na desno: crvene, bijele i zelene boje.
Nakon što su grb i zastava Federacije proglašeni neustavnim, raspisan je konkurs za novo idejno rješenje. U užem izboru su se našla tri prijedloga, koja je Predstavnički dom uslovno usvojio, ali Dom naroda ih nikada nije razmatrao.
Interesantno, Republika Srpska, od 16. juna 2007. godine, koristi amblem koji sadrži elemente entiteta.
Na amblemu se nalaze stilizirani inicijali “RS” u središtu, oko kojeg stoji naziv entiteta ispisan ćirilicom i latinicom. U podlozi inicijala nalazi se zastava Republike Srpske, trobojka okružena zlatnim hrastovim lišćem. U podnožju amblema smještena je lenta u bojama zastave.
Amblem također prikazuje dvije krune: krunu Nemanjića na vrhu i krunu Kotromanića na dnu.
Amblem je usvojen kao privremeno rješenje i trebao je biti u upotrebi do usvajanja novog grba. Novi grb, koji je usvojen 15. jula 2008. godine, Ustavni sud Republike Srpske proglasio je neustavnim u decembru iste godine. Tako da je postojeći amblem iz 2007. godine još uvijek u upotrebi.